Набор для приготовления библиотек РНК QuantSeq 3’ mRNA-Seq Library Prep Kit для секвенирования на платформе Ion Torrent, с набором баркодов А, Lexogen

Набор предназначен для получения библиотек, содержащих 3’-концевые последовательности полиА+мРНК, для секвенирования на платформе Ion Torrent. При этом риды генерируются в направлении 3’-концов, отражая истинную последовательность мРНК.

Для получения библиотеки достаточно 5 нг суммарной РНК, в том числе деградированной (например, из FFPE-образцов). Специфичность цепи при секвенировании составляет не менее 99.9%, что позволяет картировать риды на соответствующую цепь геномной ДНК. Это позволяет выявлять антисмысловые транскрипты и перекрывающиеся гены. Процесс получения библиотеки занимает около 4.5 часов.

Поскольку каждый транскрипт даёт только один фрагмент, не требуется нормализация по длине. Это позволяет количественно анализировать экспрессию генов с высокой точностью.

Для получения мультиплексных библиотек в состав наборов входит 24 баркода (набор А или набор В). Таким образом, в одну библиотеку можно загрузить до 48 образцов.